Quando você manda o Outlook exportar um conjunto de pastas IMAP para um arquivo PST, ele não converte só o corpo e os cabeçalhos das mensagens, mas também os seus flags (as marcações internas de estado). Entre esses flags está o \Deleted, usado pelo servidor IMAP para sinalizar que uma mensagem está “pendente de exclusão”. Mesmo que o usuário não tenha clicado em “Excluir” naquela sessão, muitos servidores (ou mesmo o Outlook no processo de exportação) marcam mensagens como \Deleted para simplificar a limpeza futura.

O Outlook, por sua vez, aplica automaticamente uma vista de IMAP que oculta tudo que esteja marcado como \Deleted. É uma configuração pensada para não mostrar lixo ou mensagens “pendentes” de serem "expunged" (deletadas de fato) no servidor. Por isso, ao abrir o PST no Outlook, ele “esconde” essas mensagens até que você mude a vista para “Mensagens IMAP” (que remove esse filtro de exclusão).

Apesar de todas aparecerem na Caixa de Entrada, internamente cada item carrega esse flag de exclusão. Para o Outlook isso significa “não exibir”, mas não “apagar”, por isso elas continuam fisicamente no PST e voltam a aparecer assim que você escolhe uma vista que mostre itens com \Deleted.

Correção da visualização:

Selecione qualquer pasta dentro do arquivo de dados > Exibir > Alterar Modo de Exibição > Primeira Opção (Mensagens IMAP):

Na sequencia faça os mesmos passos acima porém selecione a opção "Aplicar Modo de Exibição Atual a Outras Pastas de Email":

Na tela "Aplicar Modo de Exibição", selecione o Arquivo de Dados do Outlook, marque a opção Aplicar modo de exibição a subpastas, OK:

Basta acessar as outras pastas que os e-mails voltam a aparecer normalmente!